Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms