Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TTLL9Q3SXZ7 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms