Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02082-201ENST00000484765 710 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DUBR-204ENST00000490441 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC016612.1-201ENST00000505367 289 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC026785.1-201ENST00000505520 580 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PPIAP11-201ENST00000510729 493 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC138956.2-201ENST00000512934 528 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC108471.2-202ENST00000529094 498 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RNASE11-206ENST00000553849 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 EIF3J-AS1-204ENST00000560049 639 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TMX3-204ENST00000562706 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 C6orf229-201ENST00000565469 814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MT3-206ENST00000570176 579 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL217P-201ENST00000584520 286 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 IGFL4-204ENST00000601672 667 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RPL17P3-201ENST00000605695 525 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 GAPDH-211ENST00000619601 1086 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 Metazoa_SRP.177-201ENST00000621099 283 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC006449.7-201ENST00000623658 366 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL359736.3-201ENST00000626707 303 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RBMX2-205ENST00000639890 871 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TSTA3-210ENST00000529064 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL591885.1-201ENST00000440494 1799 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SPATA18-201ENST00000295213 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CYP17A1-204ENST00000638190 1506 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ADCYAP1R1-202ENST00000396211 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HADHB-202ENST00000405867 1588 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms