Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ACSL1-210ENST00000513317 2469 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL445531.1-201ENST00000562653 1728 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 LCMT1-AS2-201ENST00000562280 2601 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AL592287.1-201ENST00000637598 2074 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ALAS1-202ENST00000394965 2430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRE2-209ENST00000596991 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 MIR194-2HG-201ENST00000413053 3647 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 WASH2P-201ENST00000453662 1684 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM107-208ENST00000532998 2358 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP21-1Q3LI58 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms