Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHD9Q3L8U1 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHD9Q3L8U1 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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