Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FSCN1Q16658 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FSCN1Q16658 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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