Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIK4Q16099 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms