Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms