Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FRMPD4Q14CM0 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms