Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHPRHQ149N8 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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