Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms