Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms