Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PDE3BQ13370 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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