Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms