Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FOXO1Q12778 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FOXO1Q12778 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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