Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SEC24A-201ENST00000322887 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SYBU-222ENST00000529175 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms