Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms