Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB4BP68371 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms