Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMPOP42166 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMPOP42166 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMPOP42166 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMPOP42166 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms