Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GGCXP38435 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GGCXP38435 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GGCXP38435 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GGCXP38435 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GGCXP38435 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GGCXP38435 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms