Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
OTX2P32243 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
OTX2P32243 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
OTX2P32243 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
OTX2P32243 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OTX2P32243 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OTX2P32243 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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