Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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CASQ1P31415 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASQ1P31415 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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