Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TSPOP30536 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TSPOP30536 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TSPOP30536 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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