Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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PTPRMP28827 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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PTPRMP28827 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTPRMP28827 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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