Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PRKCHP24723 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.1 ms