Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KB1P23443 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms