Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCNA2P20248 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms