Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XBP1P17861 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XBP1P17861 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
XBP1P17861 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XBP1P17861 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms