Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HOXD8P13378 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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