Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RALAP11233 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RALAP11233 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms