Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GZMBP10144 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GZMBP10144 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
GZMBP10144 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms