Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPN1P04843 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN1P04843 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN1P04843 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN1P04843 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN1P04843 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN1P04843 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN1P04843 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN1P04843 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN1P04843 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN1P04843 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPN1P04843 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPN1P04843 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPN1P04843 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms