Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 IGHV1OR15-9-201ENST00000338912 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCC9O60706 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms