Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SPAG9O60271 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
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