Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms