Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EFCAB5A4FU69 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFCAB5A4FU69 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms