Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TTC7AQ9ULT0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTC7AQ9ULT0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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