Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms