Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP35Q9P2H5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP35Q9P2H5 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms