Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms