Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SMIM3Q9BZL3 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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