Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCGF6Q9BYE7 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms