Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms