Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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SPOCK3Q9BQ16 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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SPOCK3Q9BQ16 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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SPOCK3Q9BQ16 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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SPOCK3Q9BQ16 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 AL049829.3-201ENST00000604456 1875 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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