Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms