Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
APOBEC4Q8WW27 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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