Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTOP1Q7RTM1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms