Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPOCD1Q6ZMY3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCD1Q6ZMY3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SPOCD1Q6ZMY3 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms