Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms