Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms